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暫無內(nèi)容
1,杰毅本地化解決方案的包含了哪些內(nèi)容?
杰毅本地化解決方案包含微生物破壁儀、NGSmaster?自動化建庫儀、儀器配套卡盒以及提取建庫試劑、病原微生物基因數(shù)據(jù)分析軟件及服務(wù)器,搭配 illumina 高通量測序儀為一整套病原微生物本地化解決方案,可以為醫(yī)療機構(gòu)快速實現(xiàn)本地化開展病原微生物檢測。
2,杰毅本地化解決方案適配的測序平臺有哪些?
NGSmaster?自動化建庫儀可搭配 illumina nextseq500/550、Miseq 等測序儀。
3,杰毅病原宏基因組本地化解決方案從樣本到報告需要多長時間?
使用杰毅病原宏基因組本地化解決方案,從標(biāo)本到出具報告<13 小時。
4,NGSmaster?自動化建庫儀的通量有多大?
NGSmaster?自動化建庫儀標(biāo)準(zhǔn)是 4 個通道,一次可以做 1-4 個樣本。每個通道之間相互獨立,互不影響,可同時對不同類型的生物樣本進行處理,也可以單個樣本即刻開始提取建庫,靈活方便,適用于臨床隨時來樣的檢測場景,也符合緊急情況下需要快速對單個或是少數(shù)樣本進行建庫測序的需求。在臨床樣本量增加時,也可以將多臺儀器進行疊加使用,最多可以疊加 24 臺儀器(96 通道)。除了標(biāo)準(zhǔn)的 4 通道,還有單通道的儀器可選。
5,NGSmaster?自動化建庫儀建庫可以構(gòu)建哪些文庫,需要多長時間?
使用 NGSmaster?自動化建庫儀可以進行 DNA 建庫和 RNA 建庫。生物樣本進,文庫出,提取建庫過程均儀器自動完成,無需人工操作,DNA 文庫 2 小時完成,RNA 文庫 3.5 小時完成。
6,杰毅自動建庫為什么只需要 2 個小時就能完成?
傳統(tǒng)的建庫為手工+PCR 建庫方式,至少需要 6-8 小時。杰毅的文庫構(gòu)建使用的是 PCR-free 的建庫技術(shù),建庫過程中不進行 PCR 擴增(5 步完成建庫:核酸-片段化-補平加 A-連接-純化),從而節(jié)省了大量時間(PCR 方法建庫需要進行多步純化和 PCR)。同時儀器自動建庫,也大大縮短了人為操作時間,實現(xiàn)了 2h 可以完成文庫的構(gòu)建。
7,為什么要使用 PCR-free 的建庫技術(shù),有什么優(yōu)勢?
(1)PCR-free 建庫技術(shù)無 PCR 過程,避免了 PCR 氣溶膠污染的風(fēng)險。
(2)PCR-free 建庫無 PCR 產(chǎn)生的偏向性問題,讓結(jié)果更真實。
(3)PCR-free 建庫技術(shù)步驟少,速度快,大大縮短了實驗時間。
8,NGSmaster?自動化提取建庫儀可以做的樣本類型有哪些?
NGSmaster?自動化提取建庫儀適用的樣本類型非常全面,包括血漿、骨髓、肺泡灌洗液、腦脊液、胸腹水、膽汁、關(guān)節(jié)積液、尿液、膿腫抽液、房水、其它穿刺液、組織、痰液、鼻咽拭子保存液、傷口滲出液、肛周拭子等。
9,建庫完成后,樣本還需要進行什么處理嗎,如何進行質(zhì)控?
使用 NGSmaster?自動化建庫儀,建庫程序完成之后,直接得到文庫樣本。只需要在測序前用熒光定量 PCR 儀進行文庫定量質(zhì)控,質(zhì)控合格之后,完成 pooling 和 pooling 后質(zhì)檢,即可進行上機測序。
10,NGSmaster?自動化建庫儀占地大嗎,操作需要放在什么房間?
NGSmaster?自動化提取建庫儀相比市面上常見的建庫設(shè)備,體積很?。?18mm*343mm*418mm),可以放置在生物安全柜內(nèi),并且由于建庫使用 PCR-free 建庫技術(shù),無氣溶膠污染,不需要放置在專門的 PCR 房間,一般放置在樣本制備間即可。
11,數(shù)據(jù)分析是如何進行的和檢測報告是怎么出具的?
杰毅本地化解決方案中,數(shù)據(jù)分析使用杰毅專門的病原微生物基因數(shù)據(jù)分析軟件,該軟件搭載了物種信息系統(tǒng)、智能分析系統(tǒng)、深度解讀系統(tǒng)三大系統(tǒng),并留有 his 系統(tǒng)接口,可以進行信息對接,可實現(xiàn)樣本查詢、管理等??梢暬膱蟾嫦到y(tǒng),可為臨床一鍵式出具檢測報告,僅需 1 名臨床醫(yī)生對報告進行審核即可。測序過程中邊測序邊分析,最快可實現(xiàn)下機后 10 分鐘出具報告。
數(shù)據(jù)分析可選云端數(shù)據(jù)解決方案和本地化數(shù)據(jù)方案,云端數(shù)據(jù)解決方案無需單獨配置服務(wù)器,數(shù)據(jù)全面更新快。本地化數(shù)據(jù)解決方案數(shù)據(jù)安全性高更高,適用于對數(shù)據(jù)安全要求較高的機構(gòu)。
12,檢測的內(nèi)容哪些內(nèi)容?
杰毅病原宏基因組檢測內(nèi)容含24419種病原微生物(細菌 11027 種,支原體 54 種,衣原體 12 種,立克次體 21 種,螺旋體 48 種,病毒 11704 種,真菌 1324 種,寄生蟲 229 種)和 2000 余種耐藥基因。
13,杰毅本地化解決方案有什么優(yōu)勢?
(1)配套的微生物破壁儀,通過三維高速震蕩破壁,可顯著提高真菌、分枝桿菌等難破壁微生物的檢出,避免漏檢;
(2)NGSmaster?一站式、自動化建庫系統(tǒng)可快速、2h 無人值守,可自動化完成樣本的核酸提取和文庫構(gòu)建,提升檢測時效性,降低污染風(fēng)險,保障了生物安全;
(3)配套的卡盒式試劑盒,實驗前只需要將樣本和提取建庫反應(yīng)試劑都預(yù)先加入卡盒中,后續(xù)通過自動化建庫儀自動完成提取和文庫構(gòu)建,省時省力。
(4)采用了 PCR-free(免擴增)建庫技術(shù),可顯著提升檢測時效性,規(guī)避 PCR 偏好性以及潛在的污染風(fēng)險,保證結(jié)果的真實性;
(5)本地化數(shù)據(jù)分析軟件集數(shù)據(jù)庫、自動化分析軟件、智能化 AI 解讀于一體,無需生信分析人員,一鍵生成檢測報告,測序完成后最快可 10 分鐘出具報告。
杰毅生物技術(shù)在行業(yè)中的優(yōu)勢?
杰毅生物是專注于為臨床提供分子診斷服務(wù),秉承自主創(chuàng)新與追求卓越的理念,視自主研發(fā)的核心技術(shù)為生命,持續(xù)不斷地在臨床轉(zhuǎn)化領(lǐng)域進行技術(shù)研發(fā)投入。自主研發(fā)了 Q-mNGS 定量技術(shù)、NGSmaster 自動化檢測、PCR-free 建庫技術(shù)、微生物破壁儀、去人源技術(shù)等。
1) 從樣本到報告,全流程<13 小時,業(yè)內(nèi)最快。
2) Q-mNGS 定量技術(shù)——可明確樣本中人源和病原體核酸含量,對真/假陰性結(jié)果進行鑒別,可根據(jù)病原體含量的變化對抗感染療效進行評估。
3) NGSmaster 病原宏基因組一體化建庫儀——全國唯一的全自動一體化核酸提取建庫儀,每個樣本獨立空間內(nèi)完成核酸提取和文庫構(gòu)建,規(guī)避了實驗員操作引入的背景菌以及樣本間的交叉污染,另外全流程僅需 2 小時,提高了 mNGS 檢測是時效性。
4) PCR-free 技術(shù)——依托杰毅生物自主研發(fā)的建庫試劑,在文庫構(gòu)建環(huán)節(jié)去除了可能引起污染及結(jié)果偏差的多步純化步驟和 PCR 步驟,既提高了 mNGS 時效性,又規(guī)避了這些步驟可能導(dǎo)致的污染和結(jié)果偏差,使 mNGS 檢測結(jié)果更真實更準(zhǔn)確。
5) 微生物破壁儀——采用三維高速振動的原理,配合不同粒徑的玻璃珠,可對分枝桿菌、真菌等厚壁微生物進行高效破壁,提高其檢出率;另外相比超聲破碎儀可能導(dǎo)致核酸過片段化造成的部分病毒、細菌的漏檢,杰毅自研的微生物破壁儀不會影響易破壁微生物的檢出率。
6) 去人源技術(shù)——杰毅自研的去人源技術(shù)采用差異裂解法的原理,快速、高效的對樣本中人源細胞進行去除,以提高微生物的檢出。根據(jù)與浙大一院的科研結(jié)果顯示,本方法可將微生物序列數(shù)占比平均提高 29.7 倍,且去人源全流程僅需 15 分鐘(其他類似方法需 2-4 小時)。
7) 自建耐藥基因檢測數(shù)據(jù)庫,從 2000 多種耐藥基因中挑選出 40 多個與表型耐藥強關(guān)聯(lián)的基因,在檢測病原物的同時,提供耐藥信息,可以作為醫(yī)生臨床用藥的參考。
8) 自建病原數(shù)據(jù)庫,補充真菌數(shù)據(jù)。
mNGS 檢測報告周期?
24 小時極致交付:實驗室從標(biāo)本到報告<13 小時。
外周血、腦脊液、肺泡灌洗液等常見樣本類型的陽性率?
外周血 50% 左右,腦脊液 40 - 50%,肺泡灌洗液 70 - 80%
耐藥基因臨床符合率?
據(jù)不完全統(tǒng)計數(shù)據(jù)約 80%。
常見的 RNA 病毒有哪些?
樣本該如何選擇?
針對主要感染病灶在肺部的患者——送檢樣本:肺泡灌洗液> 痰液> 鼻咽拭子
針對除發(fā)熱外無其他感染部位的患者——送檢樣本:外周血> 骨髓
針對呼吸系統(tǒng)感染的兒童或不適宜取肺泡灌洗液的患者——送檢樣本:痰液> 鼻咽拭子
針對腸道感染的患者——送檢樣本:肛周拭子
針對中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染的患者——送檢樣本:腦脊液> 外周血
不接受糞便樣本,但可以接收肛拭子
Q-mNGS?是什么?
Q-mNGS?全稱 Quality/Quantity mNGS(定量宏基因組檢測),實現(xiàn)了人源和病原體核酸的相對定量檢測,可溯源樣本中病原及人源核酸的真實比例,實現(xiàn)真/假陰性的區(qū)分和治療效果的監(jiān)測。